Hast du dir die Visualisierungen genau angeschaut? Es soll eben keinen "Deckel" wie in Bern geben, wie von Regierung und SBB befürchtet, sondern es sollen im wesentlichen lediglich die Perrondächer begrünt und genutzt und mit zusätzlichen Passerellen versehen werden. Der Bereich über den Gleisen bleibt weitgehend offen und lichtdurchflutet. Es geht darum, diesen ziemlich zentralen Bereich, welcher Stadtteile zerschneidet, besser zu nutzen und bessere Verbindungen zwischen ebendiesen Stadtteilen zu ermöglichen. Der Passant oder die Velofahrerin geht dann eben nicht mehr über die unattraktive Margarethenbrücke, sondern benützt die neuen Wege und kann von dort aus auf die Züge herunter schauen und sich gleichzeitig an einem erholenden begrünten Umfeld erfreuen. =)
Ich finde die Untertunnelung der Osttangente aber auch ebenso wichtig, aus genau denselben Gründen.